在活性污泥培养的早期阶段，活性污泥很少或没有。这时，在显微镜检查中会出现大量的变形虫。当变形虫占优势时，对污水基本上没有处理效果。超高负荷活性污泥系统中以鞭毛虫为主，出水水质较差。然而，在活性污泥培养过程中，鞭毛虫的出现和优势表明活性污泥已经形成并向良性方向发展。中负荷活性污泥中以草履虫为主。此时活性污泥处理效果良好。污泥发育正常，具有良好的沉淀性能和生物活性，出水水质良好。

废水中有许多有机物质，含有十几种、几十种，甚至上百种有机物质的废水也是能经常遇到的，如果对废水中的有机物质一一进行定性定量的分析，既耗时间，又耗药品。那么能不能只用一个污染指标来表示废水中所有的有机物质及其它们的数量呢？环境科学工作者经过研究发现，所有的有机物质都有二个共性：一是它们至少都由碳氢组成；二是绝大多数的有机物质能够化学氧化或被微生物氧化，它们的碳和氢分别与氧形成无毒无害的二氧化碳和水。废水中的有机物质不论是在化学氧化过程中还是在生物氧化过程中都要消耗氧，废水中的有机物质愈多，则消耗的氧量也愈多，二者之间是呈正比例关系的。

水环境中存在过量的氨氮会造成多方面的有害影响：(1)由于NH4+-N的氧化，会造成水体中溶解氧浓度降低，导致水体发黑发臭，水质下降，对水生动植物的生存造成影响。在有利的环境条件下，废水中所含的有机氮将会转化成NH4+-N，NH4+-N是还原力强的无机氮形态，会进一步转化成NO2--N和NO3--N。根据生化反应计量关系，1gNH4+-N氧化成NO2--N消耗氧气3.43 g，氧化成NO3--N耗氧4.57g。(2)水中氮素含量太多会导致水体富营养化，进而造成一系列的严重后果。由于氮的存在，致使光合微生物(大多数为藻类)的数量增加，即水体发生富营养化现象，结果造成：堵塞滤池，造成滤池运转周期缩短，从而增加了水处理的费用;妨碍水上运动;藻类代谢的产物可产生引起有色度和味道的化合物;由于蓝-绿藻类产生的，家畜损伤，鱼类;由于藻类的腐烂，使水体中出现氧亏现象。(3)水中的NO2--N和NO3--N对人和水生生物有较大的危害作用。长期饮用NO3--N含量超过10mg/L的水，会发生高铁血红蛋白症，当血液中高铁血红蛋白含量达到70mg/L，即发生窒息。水中的NO2--N和胺作用会生成亚，而亚是“三致”物质。